超级机器人大战30全关卡剧情对话分享。不少玩家可能还不太清楚游戏中各个章节的剧情内容，下面就一起来看看吧。
地球联邦军大凑基地附设第三十士官学校的学生们正在收容难民。此时他们遇上了一路旅行至此，身份不明的主角。机械兽军团来袭后，主角仿佛受到引导，搭乘上神秘机体凶鸟30。在敌人的猛攻之下，地球的防卫王牌——万能战斗母舰・德莱斯特雷伽出击对抗。击退敌人后，德莱斯特雷伽在舰长三叶指挥下踏上了征战的旅程。
孔巴德拉从坎贝尔星人的攻击中守卫了地球。为了将其基地南原联络站的力量占为己有，新吉翁的余党现身。其后德莱斯特雷伽解救了联络站。而豹马决意对抗这场危及全世界的战争，伙伴们也团结一心。击败再度出现的机械兽后，三叶请四谷提供协助，孔巴德拉V将与之同行。
孔巴德拉从坎贝尔星人的攻击中守卫了地球。为了将其基地南原联络站的力量占为己有，新吉翁的余党现身。豹马决意对抗这场危及全世界的战争，伙伴们也团结一心。德莱斯特雷伽和孔巴德拉也击败再度出现的机械兽。战斗结束后，在三叶的请求下，孔巴德拉V将与之同行。
警视厅主导推进了勇者警察计划，其核心为搭载了新型超AI的机器人。勇太成为第一号机体德卡特的朋友。但德卡特为了正式加入勇者警察，必须消除与勇太之间的记忆。在面对意图攻击勇者警察的罪犯时，德卡特回想起失去的记忆，并回应勇太的声音，合体为杰德卡而战。勇太就任勇者警察的老大后，将与德卡特一同协助一行人。
一行人照德莱斯特雷伽主机上的指示穿越迷雾后，抵达位于东京都内的杜鹃台。丧失记忆的少年裕太和古立特合为一体，挺身对抗出现在杜鹃台的怪兽。面对即使遭到破坏也会复原的城市、迷雾后的怪兽，以及看不见怪兽的民众等重重谜团，一行人在杜鹃台获得古立特的协助。其后他们将战斗的舞台扩大至整个地球圈。
殖民地・耶莱恩第三十士官学校的学生们正在收容难民。他们遇上了一路旅行至此，身份不明的主角。赞斯卡尔来袭时，主角仿佛受到引导一般，搭乘上神秘机体凶鸟30。在敌人的猛攻下，地球的防卫王牌——万能战斗母舰德莱斯特雷伽出击对抗。击退敌人之后，德莱斯特雷伽在其舰长三叶的指挥下，踏上了征战的旅程。
为了护送胡索，德莱斯特雷伽准备和民间游击组织神圣军事同盟的部队会合。此时赞斯卡尔也正朝神圣军事同盟逼近。玛贝特和修拉克队奋战时，德莱斯特雷伽及时赶来，击退了赞斯卡尔。然而，他们得知在战斗中，从地球偷渡而来的莎蒂等人失去了音信。虽然也担心莎蒂的安危，胡索还是决定继续和德莱斯特雷伽同行。
负责对战乌鲁伽鲁，隶属于GDF的MJP机关将最新锐机体AHSMB交给了兔子小队。被称为遗憾五人组的五名兔子成员，因各具个性而缺乏团队合作精神，导致在古兰泽雷都市学园的成绩并不出色，但他们驾驶AHSMB，挺身力抗乌鲁伽鲁。德莱斯特雷伽前来救援，梦想成为英雄的出大显身手，与其一同击退敌人。在MJP司令的命令下，兔子小队将与德莱斯特雷伽同行。
一行人接受说明，了解地球圈混乱的状况后，就各自的立场陷入了沉思。赞斯卡尔和其帮手吉翁部队却在此时现身，仿佛应验了目前的状况。这场战斗中，支援一行人的神秘MS也出现了。在一行人击退新出现的乌鲁伽鲁之后，神秘的MS未透露名字，径自离去。一行人在各自坚定决心的同时，将战斗舞台扩到了整个地球圈。
在勇者警察的新成员建设小队的亮相仪式上，神秘的超AI机器人影狼现身。影丸也紧追其后地出现。一行人察觉到，一连串犯罪的背后有着超AI开发者新庄的身影。看到新庄强行控制影狼的超AI而大为愤怒的建设小队在获得心灵上的成长后，成功合体为建设猛虎。建设小队和影丸最终击败敌人，以勇者警察新成员的身份与一行人会合。
钢麦斯和钻头小子被调至勇者警察，成为其新成员。但他们与其他成员缺乏默契，从第一次见面开始就问题不断。在和勇太与德卡特的交流中，两人领悟到自己身为勇者警察的使命，钻头小子合体为超级建设猛虎，钢麦斯则成功与杰德卡联手使出麦克斯加农炮。此外，古立特的伙伴新世纪中学生也加入了战局，一同击退敌人。一行人增强了战力，为接下来的战斗做出准备。
一行人照德莱斯特雷伽主机上的指示穿越迷雾后，抵达位于东京都内的杜鹃台。丧失记忆的少年裕太和古立特合为一体，挺身对抗出现在杜鹃台的怪兽。面对即使遭到破坏也会复原的城市、迷雾后的怪兽，以及看不见怪兽的民众等重重谜团，一行人在杜鹃台和古立特一同与怪兽战斗。战斗结束后，一行人获得古立特同盟的协助，离开了杜鹃台。
自迈锡尼遗迹现身的神秘少女莉莎前来迎接从新光子力研究所被叫出来的甲儿等人。此时，阿修罗男爵率领的机械兽军团突然现身。再见宿敌的甲儿在强化的机械兽进攻下陷入苦战，其后为沙也加驾驶的魔神Z所救。甲儿坐回爱机魔神Z后，终于击败阿修罗男爵。战斗结束，对底细不明的机械兽军团感到不安的一行人得知其目标为沉眠于富士山地底的迈锡尼遗产——INFINITY。
黑色骑士团的ZERO担任娜娜莉的护卫，一同造访难民营，却遭到不明人士绑架。一行人怀疑有战士之国之称的吉尔库斯坦王国参与其中，尝试潜入王国。帮助他们的卡莲与神秘男子梵等人相遇，后又与C.C.和本应丧命的鲁路修重逢。鲁路修的精神在大监狱地底的遗迹复活。一行人打倒出现的吉尔库斯坦军和机甲铠军团后，鲁路修为了救出娜娜莉而向他们提出交易。
布莱特受到执掌地球圈顶尖企业罗氏商会的斯蒂芬妮・罗邀请，由其引见某驾驶员。一行人与目的不明的新吉翁余党陷入交战，就在此时，曾以夏亚・阿兹纳布尔之名统率新吉翁的克瓦特罗・巴吉纳现身，对一行人伸出援手。得知在阿克西斯攻防战中下落不明的夏亚生还，布莱特惊讶不已，又从其口中得知了阿姆罗和卡缪的下落。
在和阿姆罗重逢前，克瓦特罗陷入了沉思。在阿克西斯攻防战中幸存的阿姆罗受畏惧其力量之人所迫，再度陷入了近乎软禁的困境，并深深为过去所苦。面对此时逼近的机械兽，阿姆罗在珍帮助下振作精神，搭乘自己整备的高达出击。一行人和阿姆罗会合后，击退再次出现的新吉翁余党。战斗结束后，夏亚和阿姆罗重逢，但两人间已有了无法跨越的鸿沟。
卡缪被软禁的奥古斯塔新人类研究所也是乔纳等人儿时待过的地方。面对意图夺取联邦军新人类研究资料的敌人，卡缪被设施中残留的意志所控制，自我几近崩溃。但看到强忍昔日伤痛，拼命战斗的乔纳，卡缪决心奋战到底。卡缪与一行人会合后击退敌人并与克瓦特罗重逢。告别过去的自己后，卡缪决定见证他的未来。
在龙马和肆虐至南美的恐怖分子战斗时，自称为号的神秘男子出现在他面前。号道出一席话，仿佛在暗示龙马的未来。战斗中，在与号一同出现的金属兽攻击下，隼人和弁庆负伤。这时，真盖塔龙飞抵战场。龙马独自驾驶真盖塔龙与金属兽战斗。打倒所有敌人后，龙马预感将来会与号重逢。
神秘的机械兽军团出现在世界各地，铁也和士郎肩负着找出其根据地的任务，并迈向最终阶段。就在两人讨论任务结束后的展望时，阿修罗男爵率领机械兽大军团展开反击，部队溃不成军。此时一行人出现并出手相助，铁也等人成功击退敌人。然而，看到十年前应该已被打倒的阿修罗男爵复活，他们心中的不安与忐忑并未消散。
神秘的机械兽军团出现在世界各地，铁也和士郎肩负着找出其根据地的任务。为了迎接两人，一行人来到非洲，却遇上阿修罗男爵率领机械兽大军团迎击。铁也与士郎现身营救与宿敌阿修罗陷入苦战的甲儿。在两人的支援下，一行人成功击退敌人。然而，看到十年前应该已被打倒的阿修罗男爵复活，他们心中的不安与忐忑并未消散。
追踪大规模犯罪组织生体网络的Gutsy Global Guard——通称GGG委托一行人前往支援其特工。GGG机动部队的护和戒道潜入生体网络的据点，救出被囚禁的人们。其后仿制异械机器人出现，护等人驾驶牙王凯号挺身迎战。和一行人携手击退生体网络后，护遇到进化人，并得知了霸界王的存在。
追踪大规模犯罪组织生体网络的Gutsy Global Guard——通称GGG委托一行人前往支援其特工。在勇太的活跃下，护和戒道冲入生体网络的据点，救出被囚禁的人们。其后仿制异械机器人出现，护等人驾驶牙王凯号挺身迎战。和一行人携手击退生体网络后，护遇到进化人，并得知了霸界王的存在。
大洋洲有了一处次元境界线极度扭曲的地点「蓝洞」，蓝洞中出现一支神秘军队，被称为异世界军。一行人前去调查蓝洞时，异世界军现身。战斗正如火如荼之际，魔法骑士和魔神出手相助。和她们携手击退异世界军后，一行人得知魔法骑士原本是这个世界的人。为了将来前往挑战神官谢加图，魔法骑士决定与一行人共同战斗。
完全融入一行人的艾尔每天都在自己热爱的机器人包围下，过着快乐的日子。和艾尔等人一起去调查据说能通往异世界的蓝洞时，一行人遇上正与异世界军交战的魔法骑士和魔神。与认识艾尔的她们携手击退异世界军后，一行人得知魔法骑士原本是这个世界的人。为了将来前往挑战神官谢加图，魔法骑士决定与一行人并肩而战。
大洋洲有了一处次元境界线极度扭曲的地点「蓝洞」，蓝洞中出现一支神秘军队，被称为异世界军。一行人前去调查时与异世界军陷入交战。战场上出现了并非异世界军的幻晶骑士。他们属于与甲罗武德军敌对的弗雷梅维拉王国的银凤骑士团。一行人与他们携手击败异世界军，保护了他们。银凤骑士团团长艾尔对此很开心，并为自己热爱的机器人激动不已。
前来调查异世界军动向的一行人从魔法骑士处得知了异世界发生的事。银凤骑士团的艾尔等人出手解救被异世界军逼入绝境的当地联邦军。这些骑士隶属于与甲罗武德军敌对的弗雷梅维拉王国。与旧友艾尔等人重逢的魔法骑士们与一行人携手击败异世界军保护了他们。决定与一行人同行的银凤骑士团团长艾尔对此相当开心，并为热爱的机器人激动不已。
一行人收到指示，要在上宇宙前先前往直布罗陀一趟，而德莱斯特雷伽计划的负责人——地球联邦军的准将菲克斯・布莱克伍德在那里迎接一行人。敌方势力却在此时来袭。此外还有神秘的敌人现身。主角在追踪疑似敌方队长的人物时，解放了自己的力量。然而，然而，这对其自身而言是禁忌之力。一行人获胜后，菲克斯准将为他们送行，他们飞往了战火四起的宇宙。
接受GGG的阿嘉松长官的邀请后，一行人和护等人一起前往GGG的轨道基地。阿嘉松长官希望一行人能参加Z计划，其最终目的是救出旧GGG。此时，生体网络却突然展开攻击。虽击退了生体网络，但其诡异行动令一行人不安。火乃纪表示阿尔加侬正是生体网络失控的原因，并说明进化人的存在与其有关。
一行人收到指示，在降落至大气层前先前往轨道基地，而德莱斯特雷伽计划的负责人——地球联邦军准将菲克斯・布莱克伍德在那里迎接一行人。敌方势力却在此时来袭。此外还有神秘的敌人现身。主角在追踪疑似敌方队长的人物时解放了自己的力量。这对其自身而言是禁忌之力。一行人获胜后，菲克斯准将为他们送行，他们降落至陷入战乱的地表。
学习宇宙局势的一行人得知民间人士为了防卫赞斯卡尔的威胁，组成了神圣军事同盟。此时赞斯卡尔也正朝神圣军事同盟逼近。正当胡索和修拉克队奋战的时候，一行人伸出援手，击退了赞斯卡尔。然而他们得知在战斗中，从地球偷渡来的莎蒂等人失去了音信。虽然担心莎蒂安危，胡索还是决定和一行人同行。
失去阿姆罗，导致战力下降的隆德・贝尔在罗氏商会米谢儿・罗的斡旋下，接收了新的高达。在测试NT高达和其驾驶员乔纳时，吉翁突然现身。乔纳与一行人会合后设法击退了敌人。战斗结束后，三叶本想委托布莱特担任一行人的司令，但他坚决推辞，反而劝说三叶做好当指挥官的心理准备。
考量到战事规模还会继续扩大，战力的补充成为了一大重要课题。这其中尤为强大的MS自然不可或缺。阿姆罗独自前往领取阿纳海姆所配发的试作机。他在月球上的荒野回想起往事，却在此时遭遇敌人。在克瓦特罗的掩护下，阿姆罗换上量产型ν高达，击退了敌人。阿姆罗得知克瓦特罗想为自己的目标只身前行后，也开始反思自己的过往。
负责对战乌鲁伽鲁，隶属于GDF的MJP机关将最新锐机体AHSMB交给了兔子小队。被称为遗憾五人组的五名小队成员，因个性独特而缺乏团队合作精神，导致在古兰泽雷都市学园的成绩并不出色，但他们驾驶AHSMB挺身对抗乌鲁伽鲁。梦想成为英雄的出大显身手，和前来救援的一行人一同击退敌人。在MJP司令命令下，确定由兔子同行。
见兔子小队遗憾状况不断，MJP的铃风布置了特训。他们收到单独任务并出击后，却因缺乏团队合作精神而陷入苦战。最后在出无私的努力和古兰泽雷都市学园的学长们——优秀驾驶员团体杜伯曼小队的帮助之下，他们脱离了险境。战斗结束候，杜伯曼小队的队长兰迪向出说明英雄的守则。他召集男生们，举办了一场特别的誓师大会。
一行人支援联邦军防卫地球圈的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
一行人收到命令，调查降落在火星德乌特罗尼克斯海的都市型巨大太空船。来自彭塔科纳世界的波赛达尔军以十分牵强的理由，对前来侦察的他们展开了攻击。被迫应战的一行人得到了同样来自彭塔科纳却与其敌对的达巴的帮助。脱离战场的他们正式接纳达巴与他的伙伴们，并获得了波赛达尔军的情报。达巴为打倒波赛达尔决定协助他们。
为了攻击以小行星带上谷神星为据点的乌鲁伽鲁，一口气扭转劣势，GDF集结起战力，一行人也收到了参与作战的命令。他们为了保护主力部队，挺身阻挡敌方部队。面对此时现身的不明强敌，出唤醒了AHSMB的部分力量。一行人虽获胜，但地球的战力受到严重打击，这场战斗实际上以败北告终。从流亡者缇欧莉亚处得知乌鲁伽鲁的真相后，他们为了提振我方士气，负起了当活招牌的重责大任。
一行人接受警视厅的冴岛总监的邀请，在度假村享受了久违的休憩时光。影丸无法融入现场氛围。此时，敌人袭击了落单的勇太，影丸挺身迎战，却被逼入绝境。前来相救的是本应不在人世的影狼。九死一生的影狼在冴岛的指示下，复活成为勇者警察的一员。与影狼重逢后，影丸十分开心，发誓今后要一同奋战。
一行人支援联邦军防卫西日本的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
一行人支援联邦军防卫东亚的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
一行人支援联邦军防卫南美的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
一行人支援联邦军防卫大洋洲的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
为了救出被吉尔库斯坦王国囚禁的娜娜莉，鲁路修请柯内莉亚出手相助，一行人也加入作战。鲁路修虽一度将主谋夏姆娜逼入绝境，却被她的无限新生GEASS逼得束手无策。几近绝望的鲁路修在C.C.的叱责下恢复冷静，最终超越了夏姆娜的GEASS。让夏姆娜陷入永眠并救出娜娜莉后，鲁路修决定投身于战斗。
第二次新吉翁抗争后，达喀尔再度设立地球联邦政府议会。克瓦特罗靠自己的情报网得知吉翁余党将袭击达喀尔后，搭乘经过调整的全装甲百式改单独出击。克瓦特罗表明自己的身份，呼吁他们停战，却反遭谴责，陷入交战。前往会合的一行人击退了恐怖分子，但也体会到战争带来的伤痛。为克瓦特罗提供情报的人们不禁扪心自问，能为现在的世界做些什么。
出答应了被分派到兔子小队的第六名成员安树的提议，与他进行模拟对战。结果以出的落败收场。优秀的全才安树表现出不满，难与周围的人打成一片，乌鲁伽鲁却在此时来袭。面对终于入侵至大气层附近的乌鲁伽鲁，一行人拼上性命守护防卫线。在这场战斗中，安树显露出了隐藏已久的凶暴人格，一举击退敌军。
一行人支援联邦军防卫L3宙域的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力维持战线，他们则前往下一个战场。
和乔纳一起为其他目的而加入的米谢儿发出委托，希望一行人能去调查赞斯卡尔帝国本国所在的L4。为自己的处境而烦恼的乔纳受到了米谢儿的鞭策。在与吉翁交战的他们面前，原本音信不明的独角兽高达3号机「菲尼克斯」现身，但乔纳未能成功将其捕获。战斗结束后，一行人向梅比打听菲尼克斯的概况。另一方面，乔纳重新下定决心，一定要再次见到寄宿于菲尼克斯中的莉塔。
指挥吉翁部队的佐尔坦・亚卡年嘲笑部下的失态。此时，乔纳正为自身力量的渺小而烦恼不已。一行人和佐尔坦率领的部队交战。这场战斗中，佐尔坦看穿了克瓦特罗的真实身份，向否定自身存在的他发起挑战。佐尔坦对插手战斗的乔纳显露出敌意，放下狠话后离去。战斗结束后，克瓦特罗承认了佐尔坦的危险性，并和乔纳一同下定决心打倒他。
一行人支援联邦军防卫L5宙域的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
一行人在神圣军事同盟秘密工厂所坐落的奥米克戎接受补给，并享受短暂的休息。胡索在街上与身为神圣军事同盟一员的母亲缪拉重逢，缪拉却被赞斯卡尔俘获了。为了拯救缪拉而单独出击的胡索虽一度陷入困境，但为成为驾驶员的奥德罗等人所救，并将自己的机体换成新型MS・V2高达。胡索驾驶V2击退了敌人，并在心中发誓要救出母亲。
一行人向将达巴等人带到太阳系的萨特星之主——伏尔・弗拉特请求协助，期盼能合作打倒波赛达尔。弗拉特的回答却十分冷漠。达巴在萨特星与行踪不明的义妹库珊・奥莉薇重逢，但她的精神已遭到波赛达尔军控制，成为他们的一员。达巴更在战斗中得知波赛达尔军已和赞斯卡尔联手。他发誓要打倒波赛达尔，救出奥莉薇。
一行人尚未掌握波赛达尔侵略太阳系的目的。为搜集情报，一行人前往已被波赛达尔军镇压的北方平原调查，然而独自进行侦察的阿姆却被十三人众的莉莉抓走。为营救阿姆，达巴虽应莉莉要求，单枪匹马与敌人对峙，但仍与其他人合作救出阿姆，更成功获得了波赛达尔军的新型重战机。获得帕拉塔星的情报后，达巴决定相信自己的做法。
一行人前往波赛达尔军的据点之一，资源卫星帕拉塔星。对波赛达尔军也拥有巨大发言权的死亡商人亚曼达拉就在这颗星球上。面对来袭的波赛达尔军，阿姆为保护达巴而出击。此时，达巴过去的伙伴蕾茜也现身救援。达巴驾驶完成的艾尔盖姆Mk-Ⅱ击退敌人。迎接蕾茜加入后，达巴得知波赛达尔军的重要干部基瓦扎正蠢蠢欲动。
为了救出被留在三重连太阳系的旧GGG，在Z计划的第一阶段，一行人和GGG共同前往木星调查。但在他们的眼前，木星遭谜之存在Triple Zero压缩。一行人虽为阻止木星化为黑洞而奋战，但在Triple Zero压倒性的力量面前陷入了苦战。此时现身的进化人和归来的凯帮助他们摆脱了困境。虽成功击退Triple Zero，但一行人仍对这个新的威胁感到不寒而栗。
掌握勾爪男一伙的动向后，一行人前往金边近郊调查。单独行动的梵与恩人卡德贝多重逢，却发现他已成为勾爪男的同伙。在一行人和卡德贝多等人交战时，神秘的敌人出现在他们面前。其队长卡路雷乌姆逼迫三叶代表一行人做出选择。最终一行人击退自称提问者的敌人，光之柱却出现在他们眼前。光之柱的存在与提问者，一切的一切都迷雾重重。
因成为霸界眷属的旧GGG成员可能出现在G岛屿都市，一行人前往该地。结果护与成为上班族的萤汰重逢。戒道在ZERO机体的袭击下负伤，火乃纪代替其驾驶牙王凯号。由于梦想中的家园遭到破坏，怒不可遏的萤汰也以觉醒人V2参战。盖塔小队在隼人和弁庆回归后大显身手，与众人一同击退ZERO机体。然而，由于成为霸界眷属的大河展开大规模作战行动，Triple Zero的威胁日益蔓延。
一行人支援联邦军防卫北美的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
一行人支援联邦军防卫非洲的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
一行人支援联邦军防卫欧洲的最前线。他们暂时取得胜利，但考虑到敌人可能再度来袭，就请当地战力守卫战线，他们则前往下一个战场。
鉴于先前发生了一连串觊觎超AI的机器人犯罪，一行人前去追踪被视为幕后黑手的最优公司。勇太将罪犯维克蒂姆逼入绝境，但维克蒂姆叫出搭载了自行开发的邪恶超AI的奇夫坦。面对奇夫坦压倒性的力量，杰德卡落败。助其脱离险境的是勇者警察的新成员迪克。然而，杰德卡不慎被敌人夺走。勇太强忍悲痛，发誓要救出杰德卡。
魔法骑士的力量受到魔神认可后，蓝洞打开了通往神官谢加图身边的道路。为了让世界恢复和平，一行人计划前去救出遭谢加图囚禁的艾美诺公主。击退谢加图的帮手甲罗武德王子克里斯托瓦尔后，谢加图终于现身。一行人经过一番激战，打倒谢加图，失去爱人的艾美诺公主怒火中烧，向他们袭来。光等人被迫打倒艾美诺公主，这才得知谢加图和艾美诺公主之间的爱情悲剧。
赞斯卡尔的战略兵器——可从卫星轨道直接攻击地球的凯拉斯基利已打造完成。和神圣军事同盟的连贺斯Jr.会合后，一行人与防卫凯拉斯基利的赞斯卡尔和波赛达尔军的主力部队交战。提问者也在此时出现，形成三方混战的局面。一行人艰难地取得了胜利后，面对赞斯卡尔远超我方预期的战略，心中愈发惴惴不安。
凯回到地球圈后，和一行人一同拜访了轨道基地。此时，弓首相以地球联邦政府信使身份现身。他为十年前GGG放逐事件道歉，凯则担任了GGG Green的代理长官。凯得知进化人・拉弥亚就是自己的宿敌。两人的战斗因Triple Zero来袭而中断。在战斗中，侵略者也加入了战局，开始攻击凯。同时被进化人与侵略者盯上的凯对身为超进化人类的自己产生了怀疑。
胡索和潜入赞斯卡尔帝国首都的一行人分开单独行动。和莎蒂重逢后，胡索得知她是赞斯卡尔女王玛丽亚的女儿。计划拯救胡索的阿姆罗和卡缪则接触了佐尔坦，在其引导下获得了ν高达和Z高达。胡索和莎蒂一起逃脱，和紧追不舍的卡提珍娜展开战斗。一行人因新型战舰的存在而预感到，赞斯卡尔即将展开另一场大规模作战。
赞斯卡尔本国所在的L4不断有人目击到菲尼克斯，此时米谢儿也向乔纳下达指示。一行人遭遇赞斯卡尔和吉翁的部队并展开战斗，菲尼克斯为他们提供了支援。佐尔坦也于此时现身。在战斗之中，佐尔坦一怒之下发动了新安州・原石的精神感应框体，同时，乔纳在菲尼克斯身上感受到寄宿于其中的莉塔意志，选择挺身面对。击退了敌人之后，菲尼克斯径自离去。战斗过后，阿姆罗鼓励了会成为新可能性的乔纳。
一行人前来调查频发的联邦军运输舰事故，却听到神秘的铃声。他们与出现在那里的波赛达尔军交战，并因发出铃声的法拉驾驶的扎恩尼克超长距离炮击而陷入苦战。胡索驾驶V2高达突击歼灭型，击退了老友法拉。他为战争对人带来的影响感到恐惧。赞斯卡尔终于将脑波传导兵器投入到战场中，这令一行人深感不安。
一行人顺道拜访温蒂的故乡常绿镇，这里也是她和梵的相遇之地。他们在此地遇到一群热情的老人。这些老人就是从前的英雄，驾驶机甲铠的艾尔多拉小队。另一方面，梵接受了机甲铠驾驶员布里希洛的挑战，但在这场战斗中，勾爪男的部下法撒丽娜却突然现身。在布里希洛和艾尔多拉小队的帮助下，一行人击退了法撒丽娜，并接纳了他们。不知为何，布里希洛对梵总有几分好奇。
面对不想与周围人打成一片的安树，兔子小队不畏辛劳反复试错，但并未得到理想效果。此时，兔子小队带着安树单独执行巡逻任务，却遇上了乌鲁伽鲁。其后强敌吉亚特现身，出终于成功以自己的意志唤醒AHSMB，和安树等成员达成了像样的团队合作。战斗结束之后，面对出有些异于往常的言行举止，一行人觉得不太习惯。
降落至地球的赞斯卡尔摩托战舰对世界各地展开侵略。为了阻止他们的地球净化作战，一行人奋力出击。战斗中，梵败于勾爪男的手下吴。就在赞斯卡尔打算将胡索的母亲掳为人质时，提问者出现并逼迫三叶做出选择。梵经历九死一生后大显身手，助一行人取得胜利，但与在金边时一样，光之柱再度出现在他们眼前。
由于自己创造的杜鹃台受光之柱影响变得不稳定，茜心烦不已。和上次一样经历不可思议的过程后，一行人来到杜鹃台展开了调查。此时，六花遇到了神秘少年安奇。另一方面，裕太遇见自称怪兽的少女阿诺希拉斯，并从茜和幕后黑手亚历克西斯・凯利夫处得知了杜鹃台与怪兽的秘密。一行人最终战胜怪兽军团和提问者，但裕太和古立特同盟因茜而陷入了烦恼。
屡战屡败的乌鲁伽鲁军团长克莱因为了洗刷污名，降落至大气层，意图攻击拥有丰富遗传基因的古兰泽雷都市学园。在乌鲁伽鲁和一行人的战斗中，铁也和大魔神不慎被地狱博士抓走。最终克莱因虽被击退，但新光子力研究所遭到压制，位于地下的INFINITY也落入地狱博士手中。就在一行人下定决心救出铁也时，浅木因感到自己比不上出而大觉痛苦。
为了准备与INFINITY作战，甲儿计划强化魔神Z。而为了响应在全人类面前现身的地狱博士，布罗肯伯爵率领的机械兽军团也出动了。在各方势力混战厮杀的战场上，相信可能性的甲儿启动了魔神Power。甲儿与一行人挺身对抗以铁也为钥匙启动的INFINITY。最终他们成功救回铁也，但INFINITY被地狱博士回收。
一行人对抗着持续扩张势力的异世界军，来自异世界的另一股势力——法雷恩皇女阿洲花却出现在他们面前。任性的阿洲花将一行人耍得团团转时，风只身潜入了船舰。被风教训后，她使用幻术召唤出巨大山伊，想将风占为己有。一行人打倒巨大山伊，阿洲花感受到风的善良，警告一行人后就离开了。
一行人对抗着持续扩张势力的异世界军，来自异世界的另一股势力——志积达的塔朵拉、妲妲王女姐妹出现在他们面前。塔朵拉等人抓住海当作人质，为拯救贫穷的母国而意图利用一行人。海在决斗中战胜她们，异世界军却在此时出现。海和一行人为了守护塔朵拉等人而展开战斗。两姐妹被海的气魄感动，依约放弃利用一行人的想法。此时，某个不在场的人却勾起了海的思绪。
为了拯救在敌人操控下开始破坏城市的杰德卡，一行人不断追赶维克蒂姆。出现在勇太面前的维克蒂姆为了测试邪恶超AI的力量，让杰德卡和一行人展开战斗。杰德卡的超AI在勇太的呼唤下复活，但装甲奇夫坦又让他们陷入了困境。其后杰德卡和迪克火焰奇迹般地合体为火焰杰德卡。一行人与同样合体了的全能古立特携手击败敌人，接回达卡德。
听闻有别于之前遇过的异世界军的敌人传闻后，艾尔为新兵器的出现雀跃不已。在一行人与异世界军交战时，甲罗武德的帮手柯特赞的NSX现身了。甲罗武德的奥拉西欧・高加索也出现在舰桥上。光向寻求锡菲罗「柱」之力的柯特赞司令官伊格尔发起了挑战。柯特赞被提升力量的魔神逼退，奥拉西欧则与伊格尔等人告别，以求独自完成研究。
为防备霸界王者杰达的威胁，一行人拜访轨道基地。侵略者和ZERO机体来袭。霸界王者杰达亦现身，白银毁灭锤令一行人陷入苦战。在进化人的帮助下凯获得了我王凯牙，成功战胜威胁。经过净解后，J、露妮和GGG的伙伴们也恢复了正常，凯也和命重逢，但被次元扭曲吞噬的纱孔罗失去了音信。
收到伏尔・弗拉特的联系后，一行人决定前往打探波赛达尔军重要干部基瓦扎・罗瓦的动向。途中，达巴接受了鲁路修的忠告。同属波赛达尔近卫师团的奥莉薇也在牵制基瓦扎的行动。基瓦扎和奥莉薇迎击现身的一行人。战斗中达巴因犹豫而陷入困境，被鲁路修所救。战斗过后，基瓦扎为了证明自身清白，将奈伊交给波赛达尔充当人质。
一行人从拥有独自情报网的克瓦特罗处得知了正在追踪菲尼克斯的吉翁动向。一行人正在对抗吉翁和基瓦扎的部下组成的联合军时，菲尼克斯和追踪它的佐尔坦也出现在他们面前。战斗中，情绪激昂的佐尔坦叫来了Ⅱ新吉翁号，但乔纳的NT高达发动NT-D系统，并夺取了控制权。乔纳被寄宿在菲尼克斯上的莉塔意志解救，恢复自己的意识，击退了佐尔坦，阿姆罗也得知了克瓦特罗战斗的目的。
克瓦特罗的情报来自至今仍仰慕他的人们。克瓦特罗拜访了成为他们据点的阿克西斯，娜娜伊为他的变化而开心。但就在此时，赞斯卡尔出现了。为了佯装自己与阿克西斯毫无瓜葛，克瓦特罗假装被阿克西斯追赶，独自面对敌人。此时，一架神秘的MS前来支援克瓦特罗。一行人也与他会合，合力击退敌人。克瓦特罗离开后，协助者们在心中期盼有朝一日能与他再次相会。
在菲克斯准将邀请下，三叶等人造访第三十士官学校，参加了毕业典礼。主角在那里只身迎击了出现的提问者，却又败于卡路雷乌姆驾驶的古拉凡林。卡路雷乌姆逼迫前来救援的三叶做出选择。主角和菲克斯对峙，以自己的意志决定生存方式后，驾驶其新伙伴凶鸟30th展开战斗。一行人也和他会合，击退卡路雷乌姆。战斗结束后，和三叶共度了一段时光的主角肯定了自己选择的生存方式，并再次下定决心。
在菲克斯准将邀请下，三叶等人造访第三十士官学校，参加了毕业典礼。德莱斯特雷伽迎击出现在那里的提问者，主角却败在卡路雷乌姆的手下。卡路雷乌姆逼迫三叶做出选择。主角和菲克斯对峙，以自己的意志决定生存方式后，驾驶他的新伙伴凶鸟30th展开战斗。一行人此时也和他会合，击退卡路雷乌姆。 战斗结束后，和三叶共度一段时光的主角肯定了自己选择的生存方式，并再次下定决心。
察觉到机械兽军团动向的一行人决定在乞力马扎罗迎战敌人。于是达巴与亚曼达拉重逢。在与机械兽军团战斗时，卡路雷乌姆现身并逼迫三叶做出选择。地狱博士看似早已知道第三根光之柱的存在。其后，勾爪男一伙人也在此现身。击退所有敌人后，一行人得知光之柱的存在正在扭曲这个世界。
在号的引导下，一行人来到新富士研究都市，并得知地狱博士渴望战争。在对抗机械兽军团的过程中，为了与龙马做出了断，号的真龙展开攻势。地狱博士出现在战胜号的一行人面前，并将甲儿引诱至相邻次元，令他与一行人分开。然而，一行人也集结了盖塔的力量与GGG的智慧，冲入相邻次元。最终甲儿与伙伴携手打开了可能性之门，打倒了地狱博士。
甲儿在一切的起点光子力研究所发誓未来要当研究人员。但出现在那的阿修罗和布罗肯使魔神Z和真盖塔龙失控。那股能量令地狱博士和INFINITY从分歧的世界线复活。甲儿相信未来的可能性，借此召来了自己打造的全新魔神・魔神凯撒。用魔神凯撒的力量打倒INFINITY后，甲儿重新立下了誓言。
为了调查人称黑翼的神秘兵器，一行人前往异世界军的势力范围。一行人击退柯特赞的NSX后，黑翼赫然现身。那是奥拉西欧为甲罗武德开发的新兵器——飞龙战舰。此时，对光极为执着的少女新星也出现了。在神秘男子兰迪斯帮助下，一行人成功击退敌人。光对新星的存在感到不安，同时也十分在意兰迪斯。
为了逮捕开发出奇夫坦，以邪恶超AI对抗勇者警察的维克蒂姆，勇太心生一计。在裕太遇到茜时，被勇太的作战计划逼入绝境的维克蒂姆发现自己其实是仿生人。此时，神秘的奇夫坦军团救助了维克蒂姆。最终一行人虽成功击退奇夫坦军团和怪兽，维克蒂姆却已逃之夭夭。维克蒂姆得知自己诞生于幕后黑手诺埃伯・佛尔佐格之手。
一行人前往调查被视为赞斯卡尔新兵器实验场的殖民地马其顿。在神秘声音的引导下，胡索和莎蒂擅自潜入马其顿，结果胡索不慎被捕。胡索逃过了鲁佩・西诺的可怕拷问，但卡提珍娜设下的恐怖陷阱正等待着他。胡索借助莎蒂的声音脱离困境，并击退了紧追不舍的鲁佩・西诺和皮皮尼登。一行人切身感受到赞斯卡尔会在近期将新兵器投入实战。
为了打探波赛达尔侵略太阳系的目的而前往其重要据点资源卫星帕拉塔星的路上，鲁路修要求达巴下定决心。达巴等人劝说帕拉塔星的居民反抗，但基瓦扎的部队却出现于此，佯装发生意外，对帕拉塔星展开攻击。 就在帕拉塔星的动力炉即将爆炸之时，莉莉丝带着祖先的记忆化险为夷。看到莉莉丝和伙伴们舍生忘死的模样，达巴透露了自己真正的名字，展现出自己的决心。
得知吉亚特和路美思的秘密后，拉达被迫舍命出击。为了查清乌鲁伽鲁用来侵略太阳系的闸门的位置，一行人发动强行侦察。担任前锋的是环和杜伯曼小队。现身迎击的露迪艾尔和拉达令一行人陷入了苦战，但在帕特里克的拼死努力和团队合作下，作战行动以成功收场。一行人欢庆胜利时，吉亚特处死了试图逃亡的拉达。
一行人按地狱博士所言，前往安第斯，途中四谷告诉他们来自外星的威胁正步步逼近。在一行人和巴拉克星人及新星战斗时，卡路雷乌姆现身逼迫三叶做出选择，并使光之柱出现。柯特赞一伙人和兰迪斯加入后，一行人在影丸的新型态——勇者加农炮的帮助下获得胜利。其后，将德莱斯特雷伽带来地球的欧奇达切亚出现在一行人面前。
梵因星期四・神裁出状况而倒下。此时，勾爪男提议进行交涉。勾爪男的使者法撒丽娜讲述了他的目的和他将不久于人世之事，但一行人否定了勾爪男自以为是、强加于人的善意。战斗中，梵利用原体七的机甲铠修复了星期四・神裁，重回战线，并在愤怒之下展现出惊人的力量。一行人获胜后，决定齐心协力阻止勾爪男。
光对新星的出现感到恐惧。就在一行人揣测新星的真实身份和目的时，异世界军展开进攻。然而新星却入侵德莱斯特雷伽，致使机动部队无法出击。光陷入绝境，但一行人反而击杀入侵的魔物，向新星步步逼近。其后在艾尔的指挥下，做好出击准备的一行人击退奥拉西欧的飞龙战舰和怪兽军团。此时，那个在背后操纵新星，冀望世界彻底毁灭之人也展开了行动。
一行人追寻一连串超AI犯罪的幕后黑手，同时也是制造维克蒂姆的人——诺埃伯・佛尔佐格。此时，茜出现在那里，并对一行人宣战。在与邪恶超AI军团和安奇战斗的一行人眼前，超AI的创造者，曾被处以冷冻睡眠之刑的伊娃・佛尔佐格复活。听到她自私的言论后，安奇在盛怒之下觉醒，成为古立特的守护者——古立特一行人虽在战斗中获胜，却对佛尔佐格母子打造的AI控制系统深感不安。
一行人追捕被吉翁共和国舍弃而单独行动的佐尔坦，对他拥有的Ⅱ新吉翁号感到不安。乔纳感受到莉塔的意志，为了阻止那股不该存在于世的力量而出击。为了对抗冀望着世界毁灭的佐尔坦和他的Ⅱ新吉翁号，莉塔与菲尼克斯一同为乔纳提供了帮助。在米谢儿和巴纳吉的支援下，乔纳和一行人击败了Ⅱ新吉翁号，将人类的可能性延续至了未来。
得知基瓦扎决定反叛波赛达尔后，达巴与一行人并未因想尽早结束战争而利用这一情况，而是决定讨伐基瓦扎。和部分赞斯卡尔势力勾结的基瓦扎虽然迎战了一行人，却不想以身涉险。加布雷为了自己心爱的奥莉薇，选择协助基瓦扎战斗，却又对基瓦扎丑恶的嘴脸心生怒火。败给一行人后投奔基瓦扎的加布雷再次认识到基瓦扎器量的狭小，并为自己的处境苦恼不已。
一行人追捕逃至萨特星的基瓦扎，另一方面，伏尔・弗拉特则希望能和达巴谈谈。弗拉特虽未显露自己真实想法，但选择了相信真诚的达巴，拒绝基瓦扎协助打倒波赛达尔的请求。基瓦扎和一行人以萨特星为舞台展开了战斗。在战斗中，救出奥莉薇的加布雷帮助了一行人。此时，奈伊也放弃了基瓦扎。一行人虽错失抓住基瓦扎的机会，但由于新伙伴的加入，再次下定了决心要终结战争。
提问者的「老师」表示，经历重重讨论后，他们找到了真理。面对出来迎接一行人的卡路雷乌姆，突然现身的欧奇达切亚燃起了熊熊怒火，用支配波动控制了德莱斯特雷伽的船员。在「老师」宣读南极宣言的时候，三叶挣脱了欧奇达切亚的控制，决意挺身奋战。一行人打败了其后出现的霸界王始源。 他们从菲克斯处得知所有真相后，以自己的意志决定继续战斗。
救出纱孔罗的一行人意图复活始源我王凯牙。面对来袭的提问者，凯等人派集GGG所有力量于一身的终极我王凯牙出击。其后，凯和进化人的战斗终于开始了。一行人和凯一同对抗进化人・重甲战骑并取得了胜利。败北的进化人承认了凯，归还了纱孔罗的意识。此时，为了响应提问者的南极宣言，各组织都开始为最终决战进行准备。
在北美大陆集结的甲罗武德军的动向让一行人感受到新星背后之人毁灭一切的意志。一行人虽然打倒了甲罗武德的王子克里斯托瓦尔，打造完成的飞龙战舰却在此时逼近。最终艾尔与一行人打败了奥拉西欧的王牌——转换功率最大化的飞龙战舰。第五柱开放后，通往提问者根据地——南极光柱的开放条件得到了满足。一行人决定先和所有敌人做出了断，再前往南极。
勾爪男的根据地浮上太平洋。一行人为阻止勾爪男的最终计划毅然发起突袭作战。在一行人打败了保护勾爪男的原体七与夏利欧后，勾爪男的机甲铠——生日挡在了他们面前。梵虽将生日逼入绝境，但获得了神之文明厄欧斯遗产的勾爪男为了实现后续计划，径自离开。此时消息传来，称赞斯卡尔与佛尔佐格母子已各自发动最终作战。
佛尔佐格母子意图利用搭载哈默尔恩系统，可控制机器的巨大要塞伟大母亲号和超AI机器人军团向全世界复仇。在和佛尔佐格母子的战斗中，新星也向光发出最后挑战。光打倒新星后，万恶之源蒂波妮雅赫然现身。佛尔佐格母子和蒂波妮雅的力量以及天使环的影响让一行人备受折磨，但德卡特和勇太的情谊引发奇迹，成为「柱」的光也许下心愿，令一行人最终取得胜利。
就在天使环即将下坠之时，佛尔佐格母子意图利用搭载哈默尔恩系统、可控制机器的巨大要塞伟大母亲号和超AI机器人军团向全世界复仇。在和佛尔佐格母子的战斗中，新星也向光发出最后挑战。接着，勾爪男和万恶之源蒂波妮雅也赫然现身。一行人因敌人的强大实力备受折磨，但德卡特和勇太的情谊引发奇迹，成为「柱」的光也许下心愿，令一行人最终取得胜利。
一行人为了阻止渴望毁灭的茜而来到杜鹃台，却目睹茜创造的世界走向崩溃。出现在一行人面前的欧奇达切亚向他们诉说杜鹃台被创造的经过。就在此时，裕太被茜所刺，身负重伤。一行人在裕太缺席的情况下，力抗怪兽军团的总攻击。裕太回想起自己的真实身份，为拯救茜化身古立特，挺身奋战。治愈茜的心灵后，古立特打倒亚历克西斯・凯利夫，成功守护了世界。
一行人为了阻止渴望毁灭的茜而来到杜鹃台，却目睹茜创造的世界走向崩溃。出现在一行人面前的卡路雷乌姆向他们诉说杜鹃台被创造的经过。就在此时，裕太被茜所刺，身负重伤。一行人在裕太缺席的情况下，力抗怪兽军团的总攻击。裕太回想起自己的真实身份，为拯救茜化身古立特，挺身奋战。治愈茜的心灵后，古立特打倒亚历克西斯・凯利夫，成功守护了世界。
打倒勾爪男后，一行人来到勾爪男的根据地，借机帮助失去哥哥米海尔的温蒂整理心情。米海尔现身向勾爪男的仇敌梵发出挑战。此时有敌人出现在决斗现场，两人决定暂时合作，法撒丽娜也效法了他们。击退敌人的米海尔和法撒丽娜为继承勾爪男遗志，决定帮助一行人，同时发誓总有一天要报仇雪恨。
一行人前往调查极度扭曲的次元境界线，却误入次元夹缝之中。在那等待他们的是自称来自过去宇宙的亚德凡特。一行人应其要求与之交战，并在获胜后回到了自己的世界。
赞斯卡尔的最终兵器——天使环可通过精神波进行大范围的精神控制。一行人与神圣军事同盟一同奋战，却被其力量折磨。塔西罗的反叛让赞斯卡尔陷入了混乱，而佐尔坦的Ⅱ新吉翁号却在此时现身，夺取了天使环，导致世界开始崩溃。一行人打倒了克罗诺克尔、卡特吉娜和佐尔坦，阻止次元崩溃，但由于佛尔佐格母子出现并从中作梗，天使环开始下坠至大气层。
赞斯卡尔的最终兵器——天使环可通过精神波进行大范围的精神控制。一行人与神圣军事同盟一同奋战，却被其力量折磨。塔西罗的反叛让赞斯卡尔陷入了混乱，而佐尔坦的Ⅱ新吉翁号却在此时现身，夺取了天使环，导致世界开始崩溃，勾爪男也现身了。 在莎蒂渴望和平的祈祷下，一行人击败所有敌人，成功守护了世界。
乌鲁伽鲁和地球人类各自集结战力，准备在闸门决战。一行人担任了攻打闸门的前锋，直捣敌军的核心。但在此时，出受到AHSMB的影响，身心失常，以致被禁止出击。提问者为了向双方军队讲述真理，也在此处现身。出为了拯救众人而出击。在战斗中，完全觉醒的出彻底驾驭AHSMB的力量，打败吉亚特，人类因此战胜了乌鲁伽鲁。
基瓦扎本想等波赛达尔和地球阵营互相消耗战力，但一行人对他展开了攻击。达巴思考着所有战斗结束后，自己该何去何从。基瓦扎本将前线交给十三人众，但部下被打倒，其不得不亲自踏上战场。连部下的信任都支离破碎的基瓦扎已不成气候。在打倒基瓦扎，断绝后方隐忧后，一行人即将与波赛达尔展开决战。
为了进行决战而进入斯维特的一行人至今仍未掌握波赛达尔的真正意图。在他们和波赛达尔军的交战时，想坐收渔翁之利的基瓦扎军也前来搅局。打倒基瓦扎后，达巴与波赛达尔展开对峙，并得知亚曼达拉才是真正的波赛达尔。波赛达尔用生化连接取得压倒性优势，却因被米安放弃而失去了力量。达巴和一行人打倒波赛达尔及基瓦扎，为彭塔科纳开创了未来。
为进行决战而进入斯维特的一行人至今仍未掌握波赛达尔的真正意图。突破前线的达巴和弗拉特一同与波赛达尔对峙，并得知了死亡商人亚曼达拉才是真正的波赛达尔。波赛达尔用生化连接取得压倒性优势，却被米安看破其丑恶的私欲而遭到放弃，因此失去了力量。达巴和一行人打倒波赛达尔，为彭塔科纳开创了未来。
打倒所有敌方组织，终结战争的一行人，为了进入提问者的根据地——子空间，前往南极。在那里等待他们到来的人赌上自己的一切，挑起了战斗。在这场双方都赌上志气、自尊与信念的战斗中，一行人最终获胜，做出了了断。就在通往子空间的光之柱开放时，即将与提问者决一死战的一行人下定了决心，誓不动摇。
为了与提问者决一死战，一行人前往南极点，目标是与子空间相通的最后光之柱。虽然尚未知道进入后要如何回到原来的空间，但没有任何人离开这支敢死队。接受了菲克斯等人的支援，突破从最后的光之柱现身的敌方部队后，一行人闯入子空间。他们与等候在此的提问者主力部队对战。获胜后，一行人即将与提问者的指导者——「老师」展开决战。
为了与提问者决一死战，一行人前往南极点，目标是与子空间相通的最后光之柱。虽然尚未知道进入后要如何回到原来的空间，但没有任何人离开这支敢死队。接受菲克斯等人的支援，突破从最后的光之柱现身的敌方部队后，一行人进入子空间。他们与等候在此的卡路雷乌姆对战。获胜后，一行人将与提问者的指导者「老师」展开最终决战。
一行人力抗企图管理地球人类的提问者指导者「老师」。「老师」召唤过去宇宙的兵器，以压倒性的力量折磨一行人。其后，手持最终兵器奥迪姆・菲尼亲自出战的「老师」表明自己就是提问者的本源，其名奎斯特。一行人打倒自认是至高存在的奎斯特，守护了人类的未来。然后，新的战斗即将开始。
为了与提问者决一死战，一行人前往南极点，目标是与子空间相通的最后光之柱。虽然尚未知道进入后要如何回到原来的空间，但没有任何人离开这支敢死队。接受了菲克斯等人的支援，突破从最后的光之柱现身的敌方部队后，一行人闯入子空间。他们与等候在此的提问者主力部队对战。获胜后，一行人即将与提问者的指导者——「老师」展开决战。
一行人和卡路雷乌姆力抗企图消灭地球人类的提问者指导者「老师」。「老师」召唤过去宇宙的兵器，以压倒性的力量折磨一行人。其后，「老师」手持最终兵器奥迪姆・菲尼亲自出战，表明自己就是提问者的本源，其名奎斯特。牺牲卡路雷乌姆，打倒自认是至高存在的奎斯特，一行人守护了人类的未来。然后，新的战斗即将开始。
一行人和卡路雷乌姆力抗企图消灭地球人类的提问者指导者「老师」。手持最终兵器奥迪姆・菲尼亲自出战的「老师」表示自己就是提问者的本源，其名奎斯特。打倒奎斯特的卡路雷乌姆成为了新的奎斯特，阻挡在一行人面前。一行人打倒卡路雷乌姆后，得知他的真正意图，向他发誓必将守护地球的未来。然后，新的战斗即将开始。
魔法骑士和银凤骑士团的少年少女关系一直很好。光等人开始说起两队骑士相遇时的事情。起初在锡菲罗相遇时，他们由于误会而交战，但亚蒂为可爱的摩可拿深深着迷，艾尔也为挺身对抗巨像兵的魔神而痴迷。他们得知魔法骑士的敌人和银凤骑士团的敌人——谢加图的军队和甲罗武德军结盟后，齐心协力击退了敌人。当时萌生的情谊至今仍将他们连结在一起。
一连串的失败让勇太丧失了自信，他请求自己崇拜的护指导勇者警察。护义不容辞，开始讲述相当于他们前辈的GGG的勇者机器人的事迹。这时出现了机器人罪犯，勇者警察想实践护的教导内容，却是徒劳一场。但他们在战斗中再次意识到自身的职责，用自己的方式取得了胜利。勇太也因此找回自信，和德卡特的情谊更上了一层楼。
贾布罗是地球联邦军的一大据点。一行人造访在一年战争和格利普斯战役中炮火连天的此地，沉浸在各自的回忆当中。苏西却在这时失去了踪影。克瓦特罗找到她后，在她的身上看到了妹妹的影子，忆起过去的种种，苏西却在这时鼓舞了他。吉翁余党步步进逼，克瓦特罗负责保护苏西，阿姆罗等人则胸怀回忆，与敌交战。阿姆罗感叹着光阴的流逝，心系自己、伙伴们和世界的未来。
六花她们指出桂之所以会在蛋糕对决中一直输给安树，原因就出在她的味觉有问题。而一旁的阿姆和蕾茜为了讨达巴欢心，也不住针锋相对。为了圆场，环提出用烹饪来决胜负，但在比赛进行得如火如荼之际，却因敌人的出现被迫中断。而阿姆等人在战斗中也不住较劲，因此陷入了危机。安树赶来救援时的粗鲁言辞令她们发现了自己的错误。打败敌人后，一行人开始思索如何满足意中人的味蕾。
一行人在海边享受短暂的休憩时光。另一方面，出和裕太则在接受战斗小队的特训。这时六花和茜重逢，但桂和环与六花亲昵的模样惹怒了茜。茜叫出怪兽，以求解决两人。出和古立特为拯救这一危机而出动，他们用特训练就的气势与毅力挡下怪兽的猛攻，让桂等人得以安全。一行人击退敌人之后，开始思考如何将在海滩上得到的教训用到战斗中。
铃风和三叶受联邦军委托担任宣传大使，因而烦恼如何提升军方形象。一阵商议之后，她们决定从部队推出偶像团体。凛凛蜜糖的成员虽经过精挑细选，却在首次登台的表演中大出洋相。这时敌人来袭，偶像们想凭借战斗中的精彩表现来洗刷众人对自己的评价，但这一行动也未奏效。大动肝火的铃风一声喝斥，令一行人脱离了险境。民众感受到他们的拼命付出，计划终于成功收场，然而此时，铃风却在借酒浇愁。
战斗小队因为被艾尔多拉小队看好，被迫参与特训。为了脱离这个状况，他们找人帮忙说服艾尔多拉小队。眼看找来帮忙的凯即将反被艾尔多拉小队说服，罗梅罗现身解围。敌人在这时来袭，战斗小队、艾尔多拉小队和胡索都上前迎击，却因敌人的伏兵陷入危机。但他们集结众人的力量，大举获胜。战斗结束，老人们将希望托付给新世代的年轻人，自己也立下了战斗的誓言。
机械技师们非常高兴看到出在激战中成长，并逐渐激发出AHSMB的性能。但出受此影响，人格发生变化。一行人对出不同以往的言行感到困惑。其中最让人惊讶的是，出的漫画变得有趣了。而发生变化的出在战斗中也是虎虎生风，但兔子成员受不了这种诡异的感觉，所有人一起吐槽，让出恢复了原状。战斗结束后，出说起保持自我的重要。
萤汰正为如何发展与火乃纪的关系而烦恼时，铁也将他叫了出来。为了让畏畏缩缩的萤汰更有男子气概，铁也和盖塔小队对他展开特训。特训中，萤汰说出了心里的负疚之事。此时敌人来袭，他英勇奋战。火乃纪为救萤汰，以血肉之躯闯入战场，而萤汰更为了保护她，展现了危急之际的爆发力。铁也对于他的表现相当满意。铁也受纯所托宣扬婚姻的美好，但不知甲儿是否听了进去。
为了打探基瓦扎降落大气层的用意，小队提议发动潜入作战。为让敌人放松警惕，少女们被选为作战成员，身穿女装的勇太和达巴也加入其中。作战奏效，负责警备任务的加布雷被男扮女装的达巴迷得神魂颠倒。他们得知了基瓦扎的目的是视察别墅的候选地址。一行人和基瓦扎的部队发生战斗，途中听见了被带到太阳系的士兵们的心声。一行人切身体会到他们与德卡特等人已踏入未知的世界。
米谢儿不参与和菲尼克斯无关的作战，为打发时间，开始帮队员们占卜。队员们接连带着烦恼去请教米谢儿，但乔纳并不认同她的言论。一行人在战斗中都因为米谢儿的占卜而士气高扬，乔纳却感到极度焦躁。他因此陷入危机，米谢儿的喝斥救了他一回。战斗结束后，乔纳就过去与今天的事向米谢儿道谢。米谢儿决定不再干涉他人的人生，开始为自己真正的目的而烦恼。
铁也向正在G岛屿都市享受假期的凯提出了决斗请求。两人的恩怨要追溯到十年前，这场决斗早在GGG出发前往三重连太阳系前就已订下。他们赌上彼此的自尊与荣耀展开激战，此时成功越狱的加斯博士出现。加斯博士用卑鄙的手段发动攻击，但默契十足的两人使出组合攻击，成功脱险。再次认同彼此实力的两人友好地一起接受了惩罚。
萤汰和艾尔参观完神圣军事同盟的秘密工厂，点燃了心中对机器人的热爱。两人畅谈部队内的机器人，却被敌人的攻击打断。然而，两人在战斗中依旧你一言我一语地说着，趁势击退了敌人。一行人虽然对两人的聊天产生兴趣并加入话题，却败在了滔滔不绝的对话下。其中，只有阿姆罗和甲儿陪他们俩聊到了最后。
魔法骑士和古立特同盟在JUNK旁谈天说地。然而，这时发生异变，魔法骑士们消失了。光等人醒来后，发现自己身处不同原理的宇宙。她们甚至连外貌都出现了变化。神秘的怪人出现在陷入恐慌的光等人面前。此时，怪兽也随之出现。光等人在古立特和兰迪斯的协助下，凭借战斗的意念打破了敌人的陷阱。光等人回到了原本的世界，但她们可爱的模样引发了一个小小的误会。
持续不断的战争让女性成员们的心中不断累积压力，对男性成员们的不满终于尽数爆发。即使达巴和甲儿等人出面，也无法平息这场风波，女性成员们在三叶的指挥下，开始独自行动。面对来袭的敌人，她们像在宣泄心中的郁闷一般，以压倒性的力量击退了敌人。男性成员们前来迎接，女性成员们也接受了他们的负荆请罪。他们体会到只有单一性别是无法创造新生命的事实，决心互助合作，一同面对今后的战斗。
由于各地频繁观测到DBD(次元境界线扭曲现象)，三叶等人感到十分不安。在一行人地球卫星轨道上调查发生于该地的DBD时，发现有人在附近打斗。那是从平行世界转移过来的SRX。受到保护的SRX小队为了找寻回到原本世界的方法，决定协助三叶等人。
由于各地频繁观测到DBD(次元境界线扭曲现象)，三叶等人感到十分不安。在一行人前往拉萨调查发生于该地的DBD时，发现了有人在附近打斗。那是从平行世界转移过来的赛巴斯塔。受到保护的正树为寻找回原本世界的方法，决定协助三叶等人。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往仰光。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往敖德萨。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往吉尔库斯坦。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往贝洛索斯宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往卡伯特宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来来强化部队，一行人前往罗马。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往盂兰盆宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往安克雷奇。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往名古屋。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往墨尔本。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往波罗蜜多宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往埃利亚宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往温尼伯。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往朱苏德拉宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往克尔特・雷阿尔宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往爱格伯特宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往喀土穆。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往赫斯珀里得斯宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往奥尔德林宙域。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
超古代文明的遗产在世界各地沉睡着。为获取其力量来强化部队，一行人前往布宜诺斯艾利斯。击败驻守在该地的敌人后，众人从部分遗产中获得了强大的零件。
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「超级机器人大战」30周年纪念典礼将要举行。一行人守住了要在典礼上展示的纪念碑，并对今后的战斗再次表示了决心。
一行人收到了持续发送来的1900万信息。想要解开这个谜题的一行人在心中发誓要超越1900万。
