Vector NTI 生物序列比对软件vNTI 生物序列比对软件 10.3

Vector NTI序列比对软件是采用生物技术研发功能型的生物工程学软件。也是分子生物学应用软件，包括四个组件，分别对DNA、RNA和蛋白质进行各种分析和操作。它可以满足不同生物学研究人员和学习者的需求。Vector NTI可以对DNA的生物学数据，限制酶，引物分析，蛋白质和其他类型的操作进行详细的模拟和进化分析。 它可以有效，详细地有效分析各种生物元素，还可以生成晶格关系图。 它是您管理，查看，分析和转换分子生物学数据的好帮手。

下载地址

https://pan.baidu.com/s/1jGrAJcE

软件特点

1、分析GenomBench

genombench是Vector NTI提前的基因组项目的主力。genombench可以容纳一个碱基的基因组片段，可以检索从兼容的系统兼容的服务器上的数据，例如UCSC和Ensembl。它提供了浏览和查询这些网站使用关键词，界面两侧标记，BLAT(UCSC数据库)或SSAHA(的)。genombench还提供以下先进的搜索和分析工具，它是运行在分析监控

2、对分子序列的操作

我们以一个DNA序列为例，进行一系列的常规分析;最后将此DNA序列翻译成氨基酸序列，并对此氨基酸序列进行各种分析。

3、对齐显示设置——Consensus Calculation Tab

一致性序列是一个理论上有代表性的核苷酸序列，其中每个核苷酸代表在同一位点上在同一位点上经常看到的残基，或由其他标准选择。“对齐设置”对话框中的“一致性计算”选项卡指定如何以对齐方式计算对齐窗格中作为底部序列的一致序列。

简单使用说明

（一）导入外源序列的方法

点击Project菜单中Add Files命令，选择需要比较的序列文件，点击打开按钮，确认是DNA/RNA还是Protein Sequence后，点击Import按钮就可以完成序列的导入任务。

（二）以演示Project来讲述AlignX的使用

1．选择Project菜单Open命令，找到Vector NTI的Demo Projects文件夹，打开DNA.apr文件；

2．在文本窗口中，使用鼠标左键双击任一文件名，就可以得到该文件的所有基本信息；

3．建立一个新的比较策略并进行比较：

①在文本窗口中，按住Ctrl键选中四个序列：AF××××

②点击Alignment菜单中Alignment Setup命令，出现Alignment Setup对话框，在此对话框中有30个选项来确定最终比较结果展示方式，这里我们使用默认值即可。

③点击Alignment菜单中的Align Selected Sequence命令，片刻后程序完成比较并给出结果和进化树；

④在View菜单中，我们可以通过Edit Alignment命令来编辑比较结果，使用Display Setup命令来改变结果的展示方式和颜色等。

4．结果的导出：

①进化树的导出：激活进化树窗口，点击工具栏中的Export Tree按钮即可将进化树保存为.Ph文件，并可被其他树编辑软件所识别。或者点击Edit菜单中的Camera命令，将图像保存到剪贴板后在Word等文档编辑软件中粘贴；

②序列比较结果的导出；点击Project菜单中的Export MSF Format命令，将结果保存为.msf文件后，用GeneDoc打开进一步进行编辑和修饰。

小编点评

Vector NTI生物工程学软件是由informax公司推出的生物工程软件。能帮助检测基因序列，进行相关项目的分析，Vector NTI目前广泛应用于生物科技领域，方便研发人员对序列进行分析演算。